Baseando-se nos conceitos estruturais de Maria Montessori a Casa de Aprendizagem Infantil é desenvolvida para sustentar o conceito fundamental de Montessori, que em sua obra pedagógica afirma que as crianças necessitam de um ambiente apropriado onde possam viver e aprender. A Casa de Aprendizagem Infantil tem como proposta ser efetivamente o segundo Lar das crianças, priorizando a autonomia e o respeito as diversidades, em um ambiente onde as crianças se sintam livres para viver, aprender, desenvolver suas aptidões para organizar a própria existência e exercer o senso de responsabilidade.  

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O processo de alfabetização da Casa de Aprendizagem Infantil tem como base teórica o construtivismo abordado nos estudos de Emilia Ferreiro. Neste processo, a alfabetização não é considerada uma metodologia com aplicação mecânica e repetitiva, e sim como um processo de construção do conhecimento, onde o meio em que a criança está inserida serve como estímulo para esta construção. O papel do professor é de fazer intervenções mediadoras no processo de aprendizagem, em que a passagem de um nível de conhecimento para outro é gradual e depende de como vai ser trabalhada cada etapa.